色譜工作站是一種輔助色譜儀器采樣、收集色譜檢測器當中的電壓信號數據分析處理的工作站輔助軟件。色譜工作站的功能有：
(1)自行診斷功能：可對色譜儀的工作狀態進行自我診斷，并能用模擬圖形顯示診斷結果，可幫助色譜工作者及時判斷儀器故障并予以排除。
(2)全部操作參數控制功能：色譜儀的操作參數，如柱溫、流動相流量、梯度洗脫程序、檢測器靈敏度、*大吸收波長、自動進樣器的操作程序、分析工作日程等，全部可以預先設定，并實現自動控制。
(3)智能化數據處理和譜圖處理功能：可由色譜分析獲得色譜圖的各個參數值，包括色譜峰的保留時間、峰面積、峰高、半峰寬和色譜柱的柱效、分離度、拖尾因子等，并可按歸一化法、內標法、外標法等進行數據處理，打印出分析結果。譜圖處理功能包括譜圖的放大、縮小，峰的合并、刪除、多重峰的疊加等。
(4)進行計量認證的功能：工作站儲存有對色譜儀器性能進行計量認證的專用程序，可對色譜柱控溫精度、流動相流量精度、氘燈和氙燈的光強度及使用時間、檢測器噪聲、自動進樣器的線性等進行監測，并可判定是否符合計量認證標準。
色譜工作站的出現，不僅大大提高色譜分析的速度，也為色譜分析工作者進行理論研究、開拓新型分析方法創造了有利的條件。
