AXIMA-TOF²是高靈活性研究級(jí)別的質(zhì)譜儀。可分析從蛋白質(zhì)組學(xué)及各種生物或有機(jī)樣品的高能MS/MS到大分子完整蛋白的分析。

      AXIMA-TOF²的主要特點(diǎn)：
 
①配備真正的CID室，可進(jìn)行20keV高碰撞能的MS/MS解析。與以往的 Post Source Decay （PSD） – MS/MS比較，可獲得信息量豐富的MS/MS數(shù)據(jù)，提高蛋白質(zhì)解析的準(zhǔn)確性可靠性。

②對(duì)以往的Curved Field Reflectron進(jìn)行多次改良而成的novaCFR實(shí)現(xiàn)了MS/MS測(cè)定的高靈敏度化。

③新開(kāi)發(fā)的雙離子門 monoPULSE 在1,000Da上的分辨率為400，即可以分離出質(zhì)量數(shù)相差約2Da的母離子進(jìn)行MS/MS測(cè)定。

④利用Low Mass Zoom功能，可進(jìn)行低質(zhì)量區(qū)域的碎片離子高靈敏度高分辨率的檢測(cè)。

⑤特別是在蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域，Peptide Mass Fingerprinting （PMF） 解析的自動(dòng)化、根據(jù)PMF解析結(jié)果的數(shù)據(jù)依賴的MS/MS解析等，實(shí)現(xiàn)了解析日常工作的自動(dòng)化。

⑥zui近，不使用二維電泳而使用LC分離蛋白質(zhì)樣品并在線進(jìn)行MALDI-TOFMS解析的“LC-MALDI法”引人注目。AXIMA-TOF²配備支持本公司已售MALDI點(diǎn)樣器 AccuSpot，對(duì)應(yīng)LC-MALDI法的軟件。

      AXIMA-TOF²的蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案包括靈活的設(shè)計(jì)滿足不同用戶的需要：從簡(jiǎn)單樣品人工操作到全自動(dòng)數(shù)據(jù)依賴的PMF和MS/MS蛋白質(zhì)鑒定，使用者可以任意選擇，二采集到的PMF數(shù)據(jù)可以由軟件自動(dòng)銜接到蛋白鑒定Mascot數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索。用戶還可以自行設(shè)定可接受的基于PMF的蛋白鑒定分?jǐn)?shù)。

      數(shù)據(jù)依賴的MS/MS分析：根據(jù)PMF檢索結(jié)果，可以選擇匹配的蛋白肽段進(jìn)行MS/MS分析（MS/MS確認(rèn)）；另外，也可以選擇未匹配的蛋白肽段進(jìn)行MS/MS分析（MS/MS研究）。這些MS/MS譜圖可以全自動(dòng)進(jìn)行批處理檢索，以得到更高可信度的蛋白鑒定結(jié)果。

      數(shù)據(jù)可以保存并根據(jù)需要隨時(shí)進(jìn)行再處理并送入數(shù)據(jù)庫(kù)檢索以獲取更多的信息。在進(jìn)行多肽樣品的MS/MS測(cè)定時(shí)，在MALDI離子源生成的離子在第1TOF部分飛行，在高性能離子門進(jìn)行母離子的選擇。并且，被選擇的母離子在高能量CID室通過(guò)與He氣碰撞進(jìn)行解離，之后，在配備新開(kāi)發(fā)的Curved Field Reflectron的第2TOF部分進(jìn)行質(zhì)量分離后，由反射裝置檢測(cè)器檢測(cè)，獲得MS/MS譜圖。

      Low Mass Zoom 功能是用于提高M(jìn)S/MS譜圖低質(zhì)量區(qū)域的碎片離子的檢測(cè)靈敏度以及分辨率的功能。這個(gè)功能可以彌補(bǔ)不進(jìn)行碎片離子的二次加速的Curved Field Reflectron 型TOF/TOF的缺點(diǎn)。Low Mass Zoom譜圖中，在質(zhì)量值（m/z）100前后的低質(zhì)量區(qū)域上，可確認(rèn)靈敏度以及分辨率得到提高。如下圖：

      AXIMA-TOF²*支持LC-MALDI靶板上的樣品的數(shù)據(jù)采集，然后通過(guò)MS/MS數(shù)據(jù)進(jìn)行蛋白鑒定。軟件帶有的工作流程表可以自動(dòng)提供靶板上所有樣品點(diǎn)的強(qiáng)度分布圖；評(píng)判多肽的分布；決定色譜峰的zui高點(diǎn)位置；由此列出候選樣品點(diǎn)名單，并進(jìn)行不連續(xù)樣品點(diǎn)的MS/MS數(shù)據(jù)采集。排除名單可以用于排除某些已知污染物或高分度多肽，產(chǎn)生的所有數(shù)據(jù)都被直接送入Mascot進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)檢索，得到蛋白鑒定結(jié)果。