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土壤微生物生物量碳（Soil microbial biomass C）是指土壤中所有活微生物體中碳的總量，通常占微生物干物質的40%-45%，是反映土壤微生物生物量大小的最重要的指標。

土壤微生物生物量氮（Soil microbial biomass N）是指土壤中所有活微生物體中氮的總量，盡管僅占土壤有機氮總量的1%-5%，但是土壤中活躍的有機氮組分，其周轉速率快，對土壤氮素循環及植物氮素營養起著重要的作用。

利用總有機碳/總氮分析儀測定土壤微生物生物量碳、氮原理：
新鮮土壤經氯仿熏蒸（24 h）后，被殺死的土壤微生物生物量碳，能夠以一定比例被0.5 mol/L K2SO4 提取并被定量的測定出來，根據熏蒸土壤與未熏蒸土壤測定的有機碳（氮）量的差值和提取效率（轉換系數KEC或KEN），估計土壤微生物生物量碳（氮）。
 
利用總有機碳/總氮分析儀測定土壤微生物生物量碳、氮方法：

準確稱取12.50 g鮮土于鋁盒中，均勻鋪開（不可帶入有機殘體）。放入內置裝有無醇氯仿小燒杯的真空干燥器，燒杯中放置碎紙片以便于觀察沸騰情況，干燥器用凡士林密封后抽真空，真空度控制在-0.07 Mpa以下，使氯仿沸騰3-5 min（氣溫過低可能不會沸騰）。關閉閥門后，在25 ℃黑暗培養24 h，中間隔12小時可檢查真空情況，并適當補抽真空。熏蒸結束后，打開閥門應聽到空氣進入的聲音，否則應重做。去除帶氯仿燒杯后再反復抽真空2-3次，排除氯仿。另稱取一批同等重量的土壤樣品放入浸提瓶中，黑暗放置24 h。

熏蒸結束后應立即將土樣從鋁盒中全部轉移至浸提瓶中，并加入50 mL 0.5 mol/ L K2SO4溶液，200 rpm/min振蕩30 min后過濾（或先離心再過濾）,濾液稀釋20倍，過0.45微濾膜上機測定。提取液應立即分析，或在4 ℃保存。提取液保存時間過長（>20 h）會導致測定結果下降。低溫保存下的土壤提取液會出現一些白色沉淀（K2SO4結晶），對結果測定沒有影響，不必去除，但取樣前務必搖勻。