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MolPure® Stool DNA Kit 糞便DNA提取試劑盒簡介

2021-10-14  閱讀(540)

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MolPure® Stool DNA Kit 糞便DNA提取試劑盒

  ——腸道微生物研究的利器
 

PART 01

背景簡介


1998年,Handelsman等人提出宏基因組學這概念,它是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象,以功能基因篩選和/或測序分析為研究手段,以微生物多樣性、種群結構、進化關系、功能活性、相互協作關系及與環境之間的關系為研究目的的新的微生物研究方法。隨著高通量測序技術的不斷發展,宏基因組學的研究也掀起了一波熱潮,應用范圍十分廣泛,例如環境檢測、水質檢測、挖掘功能菌株、腸道菌群檢測、新藥開發等領域。

糞便是人或動物的大腸排遺物。糞便的四分之一是水分,其余大多是蛋白質、無機物、脂肪、未消化的食物纖維、脫了水的消化液殘余、以及從腸道脫落的細胞和死掉的細菌等。一般來說,只需提取其中細菌的核酸進行研究,剩余的食物纖維、蛋白質等均會對提取造成干擾,其中食物纖維會增加裂解難度,蛋白質會降低核酸的純度,影響下游研究的開展。

為解決這些難題,翌圣研發了一款糞便DNA提取試劑盒--- MolPure® Stool DNA Kit,能高效獲得優質的糞便DNA,有利于后續對腸道微生物的研究。

 

 

PART 02

產品介紹


MolPure® Stool DNA Kit 適用于各類糞便樣本的基因組DNA提取。離心吸附柱中采用的硅基質材料為*新型材料,配合*的緩沖液配方可有效去除動物糞便中各種影響下游實驗的抑制因子,并能高效地回收糞便中的基因組DNA。提取的DNA純度高,質量穩定可靠,可適用于各種下游應用實驗,如酶切、PCR、文庫構建等。

1

產品特點

 

»  純度高:無有機提取或乙醇沉淀,下游應用不受抑制。

»  提取產量高從糞便中純化最多30 μg基因組、細菌、病毒和寄生蟲DNA。

»  操作簡便、快速:可以在1 h內完成提取操作。

»  提取產量高從糞便中純化最多30 μg基因組、細菌、病毒和寄生蟲DNA。

»  操作簡便、快速:可以在1 h內完成提取操作。

 

2

應用案例

 

MolPure® Stool DNA Kit提取糞便DNA完整度好、產量高。分別稱取6份200 mg小鼠糞便樣本,使用MolPure® Stool DNA Kit和O品牌、T品牌同類產品提取基因組DNA,50 μL ddH2O洗脫。并取等體積量的DNA,跑膠鑒定基因組完整度和條帶亮度。

l1.jpg 

圖1. 瓊脂糖電泳判定提取的基因組產量。Y為翌圣品牌,O*為進口品牌,T為國產品牌。翌圣品牌提取產量高,DNA完整性更好。

 

 

PART 03

F A Q


Q:
糞便樣品提取的DNA都是動物本身的DNA?

糞便樣品中僅含有一小部分脫落的消化道細胞,消化脫落細胞的基因組DNA,約占總DNA的0.01%。大部分DNA為細菌DNA和食物源DNA。

Q:

如何保存糞便樣品,可盡量避免遺傳物質的降解?

目前較好的保存方法是糞便與干燥硅豆混合保存,或是在DMSO / EDTA/ Tris鹽溶液中保存,可以有效減緩DNA的降解。

Q:

糞便樣品的DNA的產量如何?

糞便樣品中大部分的DNA來自于細菌和食物。糞便中細菌的含量較別大,因此,糞便DNA的含量差別非常大,一般為200 ng-20 μg不等。

Q:

糞便樣品中存在的PCR等抑制因子有何組分?

糞便樣品中含有多種微生物,其多聚糖、植物多糖、膽酸、 膽鹽、膽色素、消化液、粘液等均會對Taq酶等的活性產生影響,而影響到糞便DNA的下游檢測。

Q:

如何減少糞便樣品的污染?

由于糞便會不同程度的暴露在環境中,因而易于受到外源遺傳物質的污染,在糞便DNA的提取以及PCR擴增過程中,污染已經成為影響研究結果的重要因素。因而在DNA提取及PCR擴增過程中,所有步驟進行空白對照實驗是必要的,另外,在糞便樣品收集、保存以及提取過程中,采用嚴格的消毒措施也可以有效減少污染的機會。

Q:

糞便DNA下游PCR檢測無法擴增出特異性片段是否均為抑制劑的影響?

由于糞便樣品中含有大量的PCR等抑制因子,如果純化過程沒有將其去除掉,會影響到特異性片段的擴增。但是模板添加量也是個關鍵性問題,雖說PCR檢測對其模板是非常靈敏的,但也是有其正常的檢測域,一般要在100 ng以上,而糞便樣品含有的核DNA非常少,在純化過程中產量不高的話,會由于模板添加量在其正常檢測域之外而導致無法擴增出特異性片段。

 

 

 

PART 04

訂購信息


 

產品名稱

產品編碼

規格

MolPure® Stool DNA Kit 糞便DNA提取試劑盒

18820ES50

50T

 

 

PART 05

相關產品


 

實驗類型

產品名稱

產品編碼

PCR實驗

Hieff Canace® Gold高保真DNA聚合酶

10148ES60/76

2×Hieff Canace® Gold高保真酶預混液

10149ES03/08

電泳實驗

YeaRed核酸染料(10,000× 水溶液)

10202ES76

qPCR實驗

Hieff UNICON® Universal Blue qPCR SYBR Green Master Mix

11184ES08

克隆實驗

Hieff Clone®一步法快速克隆試劑盒

10911ES20

Hieff Clone®多片段一步法快速克隆試劑盒

10912ES10

DH5α化學感受態細胞

11802ES80/92

NGS實驗

Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina

12204ES08/24/96

 

HB210927

 

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