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按容積分為：
1.小型壓力蒸汽滅菌器：指滅菌器內艙容積不超過60L的滅菌器2；
2.大型壓力蒸汽滅菌器：指滅菌器內艙容積大于60L的滅菌器。
按空氣排放方式分為：
1.預真空式壓力蒸汽滅菌器（prevacuum sterilizer）：利用機械抽真空原理，在注入飽和蒸汽之前先將滅菌器內的空氣抽出，使滅菌器內形成負壓，蒸汽得以迅速穿透到物品內部。
2.蒸汽壓力脈沖式壓力蒸汽滅菌器（steam- flush pressure-pulse sterilizer）：利用脈動蒸汽沖壓置換的原理，用高于大氣壓的脈沖壓力，用飽和蒸汽反復交替沖壓，通過壓力差將空氣排出。
3.重力下排式壓力蒸汽滅菌器（gravity displacement sterilizer）：熱蒸汽從滅菌器的頂部或側面的進氣口進入滅菌器內，由于蒸汽質量比空氣輕，因此驅使空氣從位于滅菌器底部的下排氣孔排出（重力置換原理），排出的空氣由飽和蒸汽取代。
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