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目前液相色譜儀主要應用于以下領域
液相色譜儀是近30年發展起來的一種具有高靈敏度、高選擇性的高效快速分離分析技術。它既能用于微量組分的分析測定，又能用于大量的制備分離，靈活多樣，其應用范圍已超過其他各種分離方法，尤其在中藥樣品的分析分離方面更充分發揮它的特長，為推動該領域的進步和發展作出了巨大貢獻。
液相色譜儀是利用試樣中各組分在色譜柱中的淋洗液和固定相間的分配系數不.同，當試樣隨著流動相進入色譜柱中后，組分就在其中的兩相間進行反復多次的分配（吸附一脫附一放出）由于固定相對各種組分的吸附能力不同（即保存作用不同），因此各組份在色譜柱中的運行速度就不同，經過一定的柱長后，便彼此分離，順序離開色譜柱進入檢測器，產生的離子流信號經放大后，在記錄器上描繪出各組分的色譜峰。
目前，液相色譜儀主要用于以下領域：
1、天然藥物化學、中藥化學。這是國內目前*泛的使用方法，為了弄清楚植物中的微量有效成分，開放手工色譜柱早已不夠用了，幾乎每個搞天然藥化的實驗室都至少有一臺液相。
2、藥物雜質純化。由于合成工藝并不能做到*產率，往往伴有副產品，如何獲得微量的雜質并確定結構和含量，這就得靠液相色譜。
3、蛋白純化。相對于前者，蛋白純化的起步要稍微晚一點，但是發展很迅速。同時，由于外國儀器廠家在這個領域的優勢不算太大，目前國內也在這個領域加快發展，搶占地盤。
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