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如何用NCBI查詢基因的CDS序列

閱讀:276      發(fā)布時間:2025-6-5
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很多小伙伴合成mRNA需要得到基因的CDS序列,今天我們一起來看下基因的CDS序列是怎么找到的。

1. 打開NCBI網(wǎng)站

2. 點(diǎn)擊下列選項(xiàng),找到“Gene"


3. 選中“Gene",在搜索框中輸入基因名稱,下圖以“Human TREM2"為例,點(diǎn)擊“Search"


4. 檢索頁面出現(xiàn)的第一個就是,如下圖:


5. 點(diǎn)擊進(jìn)去,進(jìn)入基因詳情頁,可以看到有多個轉(zhuǎn)錄本,如下圖紅框圈出來的。


6. 點(diǎn)擊“reference sequence details"我們需要看下轉(zhuǎn)錄本的文獻(xiàn)引用和轉(zhuǎn)本的長度進(jìn)行選擇那個使我們所需的轉(zhuǎn)錄本


7. 看到有2個


8. 點(diǎn)進(jìn)去看下CDS序列長度,一般是選擇序列最長的,如下圖選擇了“NM_018965.4"


9. 點(diǎn)“CDS",就會彈出標(biāo)記棕色的序列,這就是此基因的CDS序列啦


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