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中國農業科學院生物技術研究所成立于1986年6月，其前身是生物技術研究中心，1999年更名為生物技術研究所，研究所圍繞作物和資源與環境兩大學科集群，堅持植物和微生物的交叉與融合，在作物功能基因組、作物蛋白質組與代謝工程、作物分子育種技術、微生物功能基因組、微生物蛋白質工程和轉基因生物安全評價與應用等六個優勢研究領域內確立重點研究方向，系統開展前沿理論與前沿技術研究。