一、環境的選擇
1.1、電鏡放置的環境要求，不能有電梯電磁干擾，不能放置在在強電井的邊上，不能放置在靠近車行道路一側的樓房內，不能有周邊震動設備的干擾。
2.2、塵埃和污染物可能會影響設備的正常運行，一方面可能間接引起電鏡內部的污染，另一方面容易導致電路板及關鍵部件的損壞，需維持設備放置環境及周邊環境的干凈整潔。
2.3、不放在有腐蝕性氣體的環境中，也不應該與其他酸堿類的物質放在一起。
2.4、電鏡放置要平穩，不能傾斜以免產生震動或者造成整機或部件的摔落。
二、溫度與濕度的控制。
2.1、室內外溫差不應過大，溫差如果過大，容易引起部分部件出現冷凝水，冷凝水過多可能會導致電路板短路，以及設備內部生銹。另外要注意控制室內濕度，過高的濕度會增加設備內部部件生銹和腐蝕的風險。
2.2、電鏡放置的濕度應當<70%，如果濕度過大需要及時使用抽濕機。
2.3、電鏡室內周邊不應當有水源，也不應當和使用水源的儀器一起使用，其中這包括但不限于空調漏水。水分若侵入設備內部，可能會導致短路或其他嚴重故障，損壞設備。
三、電鏡的開關
3.1、電鏡長期不使用時，應當切斷電源，再次使用時要檢查開機條件，包括且不限于，電源電壓，真空泵達到合適的條件才可開機
3.2、鎢燈絲掃描電鏡可以短期關機，但最好一周開機一次。場發射掃描電鏡建議維持開機狀態，特殊情況除外，例如長時間停電，UPS電源用完，搬遷等。
四、尋求專業工程師
當設備出現故障時，應立即與專業工程師取得聯系。強烈建議不要自行嘗試進行維修，因為非專業的處理可能會導致問題的惡化，增加維修難度和成本。
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