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高深度、超多重 —— 定義血漿蛋白質組學檢測新高度

閱讀:340        發布時間:2024-12-26

血漿蛋白質組學檢測在現代醫學與生命科學領域占據著舉足輕重的地位。其重要性在于能夠從蛋白質層面全面剖析血漿這一復雜的生物樣本,為眾多疾病的早期診斷提供價值的生物標志物。然而,血漿是一個復雜的樣品,血漿中蛋白質種類繁多,數量可達上萬種,且濃度分布極不均衡,濃度跨度超過 10 個數量級,其中前 22 個蛋白質約占總蛋白質質量的 99%。在其他 1%的總蛋白質質量中發現了數千種較不豐富的蛋白質,并對生物學和健康產生重要影響。目前蛋白質組研究的主要挑戰是許多當前用于研究蛋白質的方法在深度或通量方面有限,因此無法訪問足夠強大的研究來檢測生物信號中的數千種低豐度蛋白質。

 

一、Proteonano™低豐度蛋白組富集技術:

珞米Proteonano™富集低豐度血漿蛋白組試劑盒是基于選擇性親和超順磁性納米探針的技術,納米粒子直徑僅為 200 nm,并且具有均一性。其表面通過化學偶聯反應蛋白質富集探針,每個納米磁珠表面約有 300,000 個蛋白質結合位點用于富集人類蛋白質組。每個納米探針物理空間僅為10 飛升,比傳統100 μL 體系小了100億倍,這使得對低豐度蛋白質的檢測靈敏度提升100萬倍。因此,傳統質譜蛋白質組學無法檢測蛋白質組也能夠被鑒定到,這為蛋白質組學分析帶來大規模并行檢測和超寬豐度范圍,并且為大規模蛋白質生物標志物的發現提供一把研究利器。

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一、Proteonano高深度超多重蛋白組學整體方案:

Nanomation™ G1內置整套針對Nanomics Discover Panel和蛋白質組學常用試劑的工作流

客戶只需要根據程序提示擺放試劑和耗材即可開始實驗。

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一、12K人類人類血漿蛋白組數據庫

珞米12K人類血漿蛋白組數據庫在前期8K數據庫的基礎上實現了顯著擴展,現已覆蓋蛋白組學平臺的數據,涵蓋了超65%Olink 5KSomaLogic 11K蛋白組數據,約93%HPPP人類血漿蛋白質組數據庫,以及84%FDA-approved circulating biomarkers,涵蓋12000個蛋白600種疾病,是珞米在蛋白組學研究領域的一個里程碑突破。

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一、實測數據:穩定 & 客觀

蛋白質鑒定數顯著提升:不同Discover Panel檢測蛋白質數目均超過3000種,達到5000

穩定性:蛋白質定量CV平均值為15%,中位值為11%

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蛋白質鑒定深度顯著拓寬:蛋白質動態范圍橫跨超9個數量級(>9 logs),大大拓寬了檢測的動態范圍

大量低豐度蛋白捕獲:捕獲的蛋白中,70%為豐度低于10 ng/mL的低豐度蛋白

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五、血漿蛋白質組樣本標準化采集注意事項

血液蛋白質組分析是臨床蛋白質組學需要實現的挑戰性的任務之一,因為樣本的復雜性,如蛋白質在非常動態的濃度下的異質性,以及血漿/血清標本樣本收集和存儲條件不當均會對檢測結果造成的不良影響,以至得出錯誤結論為此,項目開展前,應當考察樣本質量。可能存在的樣本因素:

樣本溶血

樣本存在污染

樣本凍存時間

血漿樣本預處理方式

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推薦血漿預處理方式:

血漿:新采集的樣品在室溫下1 小時內或4℃條件下 8 小時內離心。 

血清:新采集的樣品在室溫下凝血 30-60 分鐘,然后離心。 

保存或運輸:樣品應儲存在- 80°C的冰箱中,使用干冰運輸。 

其他:

記錄如何收集和處理樣品。

保證一項研究所有樣品的處理方法盡可能一致。例如: 所有樣本離心時溫度和離心速度保持一致,血漿抗凝劑應保持一致;采集血清時,應保持凝血時間和條件一致。

如果可能盡量使所有樣品凍融循環次數保持在相同范圍內。


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