手性柱是由具有光學活性的單體，固定在硅膠或其它聚合物上制成手性固定相。不同化學性質的異構體不得不采用不同類型的手性柱。手性柱通過引入手性環境使對映異構體間呈現物理特征的差異，從而達到光學異構體拆分的目的。要實現手性識別，手性化合物分子與手性固定相之間至少存在三種相互作用。手性柱的這些相互作用通過影響包埋復合物的形成，特殊位點與分析物的鍵合等而改變手性分離結果。
在手性拆分中，溫度的影響是很顯著的。低溫增加手性識別能力，但可能引起色譜峰變寬而導致分離變差。因此確定手性分析方法過程中要考慮柱溫的影響，確定*優柱溫，以達到好的分離效果。如果使用手性柱中異構體的分離度下降該怎么辦？
分離度下降的原因有可能是色譜柱以外的色譜條件發生了變化，或者色譜柱受損柱效發生了變化。首先查看是否是因為溫度、流動相成分等外在因素發生了變化導致分離度下降，如果排除了各種外在因素就有可能是分析柱本身的柱效下降導致的。如果分離度在短時間內急劇下降伴隨柱壓上升，可能是有強極性溶劑損害了柱子；如果分離度在長時間內慢慢下降，可能是柱頭受污染或柱頭塌陷，需要更換保護柱或者更換分析柱。
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