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H.E.L生物發酵代謝研究—BioXplorer

生物過程工程通常涉及篩選許多發酵條件，以確定細胞生長和產物形成的合適條件。動態通量平衡分析（DFBA）是一種計算方法，用于分析和工程細胞行為，特別是在批量和補料分批生化反應器中占主導地位的動態培養環境中。DFBA的基本元素是動態通量平衡模型，該模型結合了細胞內代謝物的計量質量平衡與細胞外物種的動態質量平衡，通過底物攝取動力學和細胞生長速率相互聯系。當使用基因組規模的細胞代謝重建時，DFBA相較于基于現象學描述細胞生長和產物產率的傳統非結構化反應器模型，可以預期生成更準確的預測。動態通量平衡模型的驗證需要在感興趣的生長條件下執行間歇和/或補料分批實驗。由于使用標準實驗室生物反應器系統進行此類實驗可能耗時且昂貴，因此有很大的動機探索替代的細胞培養技術，以發展動態代謝模型。

案例：基于平行生物反應器系統的酵母動態通量平衡模型驗證與優化

Hanly, T. J., Tiernan, A. R., & Henson, M. A. (2013). Validation and Optimization of a Yeast Dynamic Flux Balance Model using a Parallel Bioreactor System. In 12th IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology (CAB 2013) (pp. 113). Mumbai, India: IFAC.