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麥克奧迪賦能時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究

      發(fā)布時間:2025-05-14
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時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)(Spatially Resolved Transcriptomics, SRT)是近年來發(fā)展迅速的一個研究領(lǐng)域,它結(jié)合高分辨率的空間位置信息和轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),以解析組織或細胞中基因表達的空間分布和時間變化。


時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)作為一項前沿技術(shù),在發(fā)育生物學(xué)、腫瘤研究、神經(jīng)科學(xué)、免疫學(xué)研究、再生醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、疾病模型構(gòu)建等多個生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域展現(xiàn)出廣泛的應(yīng)用潛力。

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圖1 空間解析轉(zhuǎn)錄組學(xué)的代表性應(yīng)用

(圖片來源:參考資料[1])


深圳華大生命科學(xué)研究院(以下簡稱華大研究院)作為時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)領(lǐng)域的主要推動者之一,在2022年聯(lián)合多名科學(xué)家在《Cell》上發(fā)表了題為《Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball patterned arrays》的研究論文,結(jié)合 DNA 納米球 (DNB) 模式陣列和原位 RNA 捕獲來創(chuàng)建空間增強分辨率組學(xué)測序 (Stereo-seq)。應(yīng)用Stereo-seq生成小鼠器官發(fā)生時空轉(zhuǎn)錄組圖譜(MOSTA),以單細胞分辨率和高靈敏度繪制了小鼠器官發(fā)生過程中轉(zhuǎn)錄變異的動力學(xué)和方向性。這一創(chuàng)新性的圖譜不僅深刻揭示了細胞間差異的分子根源,還清晰展現(xiàn)了大腦組織發(fā)育過程中的微妙變化,為探索遺傳性疾病的復(fù)雜發(fā)病機制提供強有力的工具


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圖2 Stereo-seq芯片工作原理及小鼠胚胎發(fā)育時空轉(zhuǎn)錄組圖譜(圖片來源:參考資料[2])

麥克奧迪助力時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究

值得一提的是,此次時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)的研究專題成果,離不開高性能顯微鏡這一關(guān)鍵工具的助力——麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡。

麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡,為華大研究院的科研人員提供了洞察微觀世界的窗口無論是生物樣本的精細結(jié)構(gòu)解析,還是基因表達產(chǎn)物的直觀可視化,PA53掃描系列顯微鏡都能以優(yōu)異的光學(xué)性能、精準的成像技術(shù)和人性化的操作設(shè)計,助力時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究的深入發(fā)展

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麥克奧迪助力時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究

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關(guān)于麥克奧迪PA53掃描系列

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PA53掃描系列是麥克奧迪光學(xué)公司自主研發(fā)設(shè)計的數(shù)字切片顯微鏡掃描平臺,它將傳統(tǒng)的玻璃切片進行掃描和無縫拼接,生成包括傳統(tǒng)玻璃切片內(nèi)所有信息的全視野的數(shù)字化切片。目前,該系列顯微鏡被廣泛應(yīng)用于生物樣品的觀察和分析、研究生物醫(yī)學(xué)材料與組織的相互作用、基因表達與檢測等領(lǐng)域,為科研和醫(yī)學(xué)診斷提供重要的手段和方法



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