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用1.8mmOD的管子取代一些藥物系統中使用的含氟聚合物管子。Agilent1100 系統在高壓流路中使用新的1/32"OD的管子。PEEK管還有其它尺寸，一般長度為50′和100′。
一個主要的制藥公司的獨立研究報告顯示將柱后通道由熔融石英管轉換為PEEK管可以使LCMS的色譜性能得到明顯改善。明顯減少了峰拖尾，而且消除了因為進樣量減少引起的峰不對稱。
Teflon管的色譜應用：聚四氟乙烯對于標準液相色譜系統的所有低壓部分都特別適用。
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