一、結構不同：
     內置式水箱自潔消毒器由兩部分組成臭氧發生器和混合器組成
     外置式水箱消毒器是一體機，臭氧發生器和混合器都一個設備上。
 二、使用方式不同
     內置式水箱自潔消毒器將混合器放在水箱底部，臭氧發生器固定在水箱外面接通電源。內置式水箱自潔消毒器的大小受水箱尺寸的影響。內置式水箱自潔消毒器應用也比較靈活方便。例如水箱自潔消毒器的一臺臭氧發生器可以佩戴兩個或三個混合器，也可以根據水箱的大小更換發生器的大小。
    外置式水箱消毒器只需要將進出水口管道連接起來打開水箱消毒器的開關即可。這種水箱消毒器主要根據水量的不同配置不同的型號。
 三、混合方式不同
     內置式水箱自潔消毒器采用由臭氧發生器通過射流器將臭氧輸送到混合器中進行氣液混合。外置式水箱消毒器是由臭氧機下面的水泵將水抽過來在泵體內進行氣液混合，之后再輸送出去。

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