首先將馬牽引至保定欄內，尾巴系于保定欄一側柱子上，馬用B超放在便于操作的一側，進行常規準備后進行直腸檢查，手握直腸探頭進行B超檢查，檢查時可適當重置直腸探頭的位置，對不同部位生殖道的大小和質地作初步判斷。檢查母馬生殖器官時，如果母馬表現過度緊張，或外界聲光過于強烈，且未對母馬進行充分鎮靜等情況下要謹慎。

    直腸超聲波檢查的步驟和注意事項與直腸觸診檢查類似。檢查時，探頭需要仔細涂抹潤滑劑，由檢查者的手掌保護探頭，把握線性探頭于手掌中，不要旋轉，控制好探頭的正面，在直腸不努責的時候向內推送探頭，檢查過程探頭必須緊貼直腸壁，在生殖道上方逐步掃描。掃描順序為膀胱、子宮頸、子宮體、右側卵巢，然后是左側子宮角、左側卵巢。隨著探頭移動，觀察B超屏幕，進行圖像判斷。
    母馬配種后13d，就可以通過馬用B超直腸探測法對母馬進行早期妊娠診斷，準確率可達90%以上。相比于傳統的直腸檢查法，診斷時間提前至少一周，對母馬刺激小，準確率高。母馬配種27d后，用B超直腸檢測準確率可達100%。（禁止轉載）