NiV可以感染各個年齡段的豬。馬來西亞的疫情顯示不同類別的豬表現出不同的臨床癥狀，例如母豬首先表現為神經癥狀，而肉用豬表現為呼吸道癥狀，此外，圈養的母豬和公豬活動受到限制，有可能掩蓋了其呼吸道癥狀。

感染后的斷奶仔豬和肉用豬表現為急性發熱癥狀，并伴有程度不同的呼吸道癥狀。患病嚴重的豬的鼻孔流出帶有血絲的黏液。同時可觀察到神經癥狀，包括顫抖、抽搐、肌肉痙攣、后肢無力及程度不同的跛行和痙攣性局部麻痹。

感染后的母豬和公豬表現為急性死亡或急性發熱癥狀，并伴有呼吸困難（氣喘），唾液分泌增多，從鼻孔流出帶有血絲和膿性分泌物的黏液。神經癥狀包括興奮、頭頸僵直、破傷風樣痙攣、四肢前伸、眼球震顫、空嚼、明顯的咽部肌肉麻痹。曾有報道NiV可導致母豬流產。

哺乳仔豬的死亡率大約為40％，哺乳仔豬感染造成的死亡以及母豬不能哺乳造成仔豬死亡各自所占的比例尚不清楚。外表健康但血清學證實為陽性的母豬仍可哺乳出健康的小豬。絕大多數感染的小豬表現張口呼吸、后肢無力并伴有肌肉震顫以及神經性抽搐等癥狀。

在一個場中，臨床發病的豬只占很少數，大部分的豬不表現任何的臨床癥狀。該病的潛伏期估計為7-14天，豬可以經消化道和其他途徑感染NiV。此病在豬群內傳播迅速，感染后10-14天可以測到中和抗體。

人、貓、狗和馬也可以感染NiV。人感染NiV后，多數以神經癥狀為主，也可以呼吸道癥狀為主，死亡率很高；狗感染NiV后，可出現類似犬瘟熱癥狀；貓感染NiV后，死亡率很高；馬感染NiV后可以出現神經癥狀，但是死亡率似乎較低。所以在臨床診斷時，應注意感染的豬場及其周圍人和其他動物的發病情況，注意發病豬場新近是否引進新豬。

死后剖檢發現NiV感染豬沒有相對特殊的病變，肺和腦膜是主要的病變器官。大多數病例表現由輕微到嚴重的肺部病變，包括程度不同的實變、氣腫、淤血性溢血以及呼吸道有帶血絲的分泌物，切開肺部，可見肺小葉間隔腫脹。腦膜彌漫性充血、水腫，其他的內臟器官沒有明顯的變化。