供試品經GC分離為單一組分，按其不同的保留時間，與載氣同時流出色譜柱，經過分子分離器接口，除去載氣，保留組分進入MS儀離子源被離子化，樣品組分轉變為離子，經分析檢測，記錄為MS圖。GC-MS中氣相色譜儀相當于質譜儀進樣系統，而質譜儀則是氣相色譜的檢測器，通過接口將二者有機地結合。                                    

實驗儀器和實驗試劑

1、儀器:二手GCMS 6890N-5975B（安捷倫質譜）
2、試劑:陽離子紅降解產物

二手GCMS 6890N-5975B實驗步驟

1、開機:二手GCMS 6890N-5975B：

①打開氮氣源，調節壓力為0.5Mpa;
②打開電腦并進入軟件界面，然后打開GC開關并完成自檢，再打開MSD開關;
③點擊界面上的Instrument圖標，進入工作站，聽到“嘟”聲后，開始進行抽真空。
 

2、方法編輯：

①在Instrument窗口欄中，從Method菜單中選取Edit Enter Method進入編輯步驟;
②在工作站進行設定參數、進樣口溫度，進樣模式、分流比、溫度。
 

3、數據采集：
①從Instrument Control中 單擊綠色圖標，編輯樣品名稱;
②單擊Start Run開始條件。

4、數據分析：
①點擊DataAnlysis 目標進入數據處理系統;
②在Pile/Load Data File下找出所需文件;
③將鼠標移至分析色譜峰，雙擊后測得到質樸圖，與結構式導信息。
 

5、關機：二手GCMS 6890N-5975B

①將儀器進樣吸柱箱溫度降至室溫;
②在Instrument Control 中選取View/Diagnestics ;
③在Dignostics 中選取VaccunNent進入放空狀態;
④放空完成后關閉工作站及電腦，然后關閉GC，后關閉氮氣鋼瓶。