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安捷倫液相色譜柱的選擇直接影響了分離效果的好壞，選擇合適的色譜柱可以縮短法開發所需的時間，并且使方法更具穩定性。
液相色譜柱由檢測器、高壓液體泵及液相色譜柱等三部分組成，其中液相色譜柱的正確安裝和使用，是液相色譜工作的關鍵，同時也是液相色譜工作者獲得正確且可靠的實驗數據的必經之路。
液相色譜柱在使用前，進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。在做柱性能測試時要按照色譜柱出廠報告中的條件進行，只有這樣，測得的結果才有可比性。液相色譜柱的分離作用是在填料與流動相之間進行的，柱子的分類是依據填料類型而定，由于所使用的樣品、流動相、柱溫等條件的差異而有所不同。
選擇安捷倫液相色譜柱時應注意：
1）在pH值正常范圍內（2~8），可選用現代高純硅膠色譜柱，具有峰形好，重現性高和壽命長的特點，選用較短的柱子可以提高分離效率，選用較長的柱子可以增加保留，選用小顆粒度的填料可以提高分離度，對分子量大的組分宜選用大孔徑填料的色譜柱。
2）分離極性大的組分采用色譜柱。
3）分離生物堿類的化合物選用經過烷基化處理封口的填料可防止堿性化合物的拖尾現象。
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