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安捷倫氣質聯用儀是結合了氣相色譜儀和質譜儀的儀器，質譜可以用于有效的定性分析，但是對于復雜的有機化合物的分析卻無能為力。色譜法是一種有效的有機化合物分離和分析方法，特別適用于有機化合物的定量分析，但定性分析比較困難。因此，這兩種方法的有效結合將為化學家和生物化學家提供一種用于定性和定量分析復雜有機化合物的有效工具。兩種或兩種以上方法的結合稱為聯用技術，而將氣相色譜儀和質譜儀結合起來的儀器稱為GC-MS。
安捷倫氣質聯用儀被廣泛用于復雜成分的分離和鑒定，它具有高分辨率的GC和高靈敏度的質譜，是定性和定量分析生物樣品中藥物和代謝物的有效工具。質譜儀的基本組件是離子源，質量過濾器和檢測器，它們位于真空主管中。它主要由以下部分組成：色譜，氣相色譜接口，質譜儀（離子源，質量分析儀，檢測器）和數據處理系統。
1、色譜部分
色譜部分與常規色譜基本相同，包括柱箱，氣化室和載氣系統。除特殊需要外，大多數不安裝檢測器，而是使用MS作為檢測器。此外，色譜部分還具有分流/不分流進樣系統，溫度編程系統，壓力和流量自動控制系統。色譜部分的主要功能是分離。將混合物樣品在合適的色譜條件下分離成單個組分，然后通過質譜儀進行鑒定。色譜儀在常壓下工作，而質譜儀需要高真空，因此，如果色譜儀使用填充柱，則必須通過接口設備分子分離器以除去色譜載氣，并使樣品氣體進入質譜儀。如果在色譜圖中使用毛細管柱，則由于毛細管中的載氣流比填充柱中的載氣流少得多，因此不會破壞質譜儀的真空，因此可以將毛細管直接插入離子源中質譜儀的。
2、氣質界面
氣體接口是GC和MS之間的連接部分，常見的連接方法是直接連接。將毛細管柱直接引入質譜儀，并用石墨墊片（85％Vespel+15％石墨）密封。接口必須加熱，以防止分離的組件凝結。界面溫度通常設置為氣相色譜儀程序升溫的高值。
3、質譜儀
安捷倫氣質聯用儀不僅是通用檢測器，還是選擇性檢測器。在離子源部分，樣品分子被電離形成離子和碎片離子，然后根據質荷比通過質量分析器進行分離，在檢測器部分產生信號，并放大并記錄質譜。
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