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氣相毛細管色譜柱因其高分離能力、高靈敏度、高分析速度等*優點而得到迅速發展。隨著彈性石英交聯毛細管柱技術的日益成熟和性能的不斷完善，已成為分離復雜多組分混合物、及多項目分析的主要手段，在各領域應用中大有取代填充柱的趨勢。現在新型氣相色譜儀、氣相色譜-質譜聯用儀基本上都是采用氣相毛細管色譜柱進行分離分析。但是，氣相毛細管色譜柱柱內徑較小，固定液的膜薄，用于食品中殘留物分析時，若使用不當，色譜柱性能很快就會下降。
氣相毛細管色譜柱優點：
1)可用于濃縮樣品。
2)樣品不需要溶劑稀釋，不存在溶劑的有害影響。
3)可注入較大體積的樣品。
4)不會引起色譜柱超載，能有效防止柱污染。
5)分流比調節容易，進樣量可大可小。
6)色譜峰窄而尖銳。
7)分析結果重現性好。
8)結構和操作簡單，有利于自動化。
氣相毛細管色譜柱缺點：
1)不適合濃度和沸點范圍寬的混合樣品。
2)不適合痕量分析。
3)操作不當會產生分流歧視。
4)由于進樣口工作時溫度較高或結構限制，對強極性樣品會產生吸附、降解或按分子重量重排反應，不適合定量分析。
5)對于揮發性和極性相近的樣品，為滿足分析重復性和定量精度要求，選取的實驗參數多，建立較佳分析方法費時費力。
6)非EPC控制，載氣浪費較大。
7)對于數量有限的貴重樣品，選用應謹慎。
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