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BOD在線監測儀采用微生物電法，將微生物膜緊貼在譜式溶解氧電的透氧膜表面，即構成微生物電。
儀器采用流通測量方式，即樣品以流動方式通過微生物電微生物膜里含有大量好氧微生物，在有氧和有機物的環境下非常活躍，氧電的輸出電流與溶解氧的濃度成正比，不含有機物的液體通過流通池時，透過微生物膜的溶解氧幾乎沒有減少。
當含有有機物的溶液經過流通池時，微生物消耗大量的溶解氧，消耗的溶解氧與有機物的濃度成正比，于是導致透過微生物膜的溶解氧相應減少。溶解氧電測出溶解氧濃度的變化量，從而計算出BOD值。
BOD在線監測儀的使用要點說明：
1.預先估計被測樣品的BOD值，如無法估計，可借助化學需氧量(CODCr)推算。一般BOD量按化學需氧量(CODCr)的70%計算大致的濃度范圍。根據水樣個數及8個培養瓶，選擇需準備平行樣數量。水樣須經過預處理其PH值應在7.2左右。
2.若發生CO2吸收劑進入樣品的情況，應倒掉樣品并重新準備新樣品。注意每個瓶子和密封蓋及管道是配套的，不能互換擰錯瓶蓋，否則數據將與瓶中水樣不對應。
3.培養瓶中轉子如有轉動不好的，輕輕搖晃瓶子使其轉動即可，但切勿搖晃幅度過大使CO2吸收劑進入水樣。
4.在正常測定時恒溫等待時間不能低于1小時，也不能高于3小時，否則影響測量結果。環境溫度接近20℃選擇恒溫1小時，與20℃溫差較大時在范圍內適當延長恒溫等待時間。
5.數據處理，儀器根據設定的取樣量可以直讀濃度。用戶只需將同一樣品的平行樣取平均值即為此水樣的BOD值。
6.清洗培養瓶、密封杯及轉子時可選用機械方法去除污垢，有條件的可選用超聲波清洗機清洗。
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