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針式過濾器在實驗室中應用廣泛，它不需要換膜和清洗濾器，省去了復雜費時的準備工作，主要應用于樣品預濾、澄清除顆粒、液體和氣體的除菌過濾，是過濾HPLC、GC小量樣品的理想方法。
樣品過濾作為前處理工作的重要流程之一，是通過除去雜質，得到濾液，來提高實驗的準確性，以及減少溶液顆粒對實驗設備造成的危害。而針式過濾器作為實驗室常用的樣品過濾耗材，該如何進行選擇呢？
1、親水性樣品：選用親水膜片，對水有親和力，適合過濾水為基質的溶液。可用的濾膜有：混合纖維素酯、聚醚砜（PES）Nylon等。
2、強腐蝕性有機溶劑：一般采用疏水性膜，如PTFE、聚丙烯（PP）等材質的濾膜。
3、蛋白溶液：選擇低蛋白吸附的濾膜，如PVDF濾膜。
4、離子色譜：通常認為PES濾膜比較適合低無機離子的溶液的過濾。
5、選擇針頭式過濾器時，除了考慮上述因素外，還要考慮樣品的體積，通常樣品量小于2 mL時，選用4 mm直徑的微型過濾器；樣品量在2-10 mL之間，選用13 mm直徑的過濾器，當樣品量大于10 mL時，選用25 mm直徑的針式過濾器。
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