ELISA操作步驟復雜，操作不當將引起較大的誤差。以下敘述各個步驟中的影響因素。
1.加樣
2.溫育
3.洗滌
4.顯色
5.比色
二、灰區的設置
通常情況下，ELISA定性實驗以“陽性”和“陰性”來報告結果，兩者間有一條分界線被稱為“陽性判斷值”（cut-off value，CO值），這是定性免疫測定結果報告的依據。
三、標本復查
ELISA手工檢測過程復雜，影響因素較多，即使室內質控在控，也可能因孔間差異而造成結果的差異，因此加大復查力度是保證結果準確性的可靠方法，比如對HBsAg、HBeAg、HCV-Ab、HIV-Ab、TP-Ab等項目的可疑、弱陽性標本及少見模式的檢測結果進行復查。
四、結果判斷和報告
常用下列幾種方法表示結果：
1.定性測定
2.半定量測定 結果一般以滴度表示。
3.定量測定 即用已知量的標準品作一系列稀釋后進行ELISA測定，繪制標準曲線，結果以量或單位表示。在ELISA定量檢測中每一塊反應板都必須繪制相應的標準曲線。
4.結果報告