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全自動酶標儀工作原理：
使抗原或抗體結合到某種固相載體表面，并保持其免疫活性。使抗原或抗體與某種酶連接成酶標抗原或抗體，這種酶標抗原或抗體既保留其免疫活性，又保留酶的活性。用洗滌的方法使固相載體上形成的抗原抗體復合物與其他物質分開，最后結合在固相載體上的酶量與標本中受檢物質的量成一定的比例。加入酶反應的底物后，底物被酶催化變為有色產物，產物的量與標本中受檢物質的量直接相關，故可根據顏色反應的深淺進行定性或定量分析。由于酶的催化頻率很高，故可極大地放大反應效果，從而使測定方法達到很高的敏感度。
對于全自動酶標儀這類專業的醫療器械，其不僅僅用于醫院檢驗科，而其可以通過偶聯在抗原或抗體上的酶催化顯色底物進行的，反應結果以顏色顯示，通過顯色的深淺即吸光度值的大小就可以判斷標本中待測抗體或抗原的濃度，這一功能已經成熟應用于我國的疾控中心。
在食品安全領域，也有全自動酶標儀的用武之地。例如它可以檢測奶粉中的三聚氰胺、可以檢測豬肉中的瘦肉精等，從而確保食品安全，保證人民群眾的身體健康。
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