正置熒光顯微鏡和普通顯微鏡在多個方面存在顯著的區別：

光源和照明方式：普通顯微鏡通常使用自然光作為光源，而正置熒光顯微鏡則使用特定波長的紫外光作為激發光源。正置熒光顯微鏡的照明方式一般為落射式，即光源通過物鏡直接投射在樣品上，這種照明方式有助于增強樣品的熒光效果。

濾鏡系統：正置熒光顯微鏡配備了一套特殊的濾鏡系統，包括激發濾光片、發射濾光片和二向色鏡。這些濾鏡能夠濾除不需要的光線，只允許特定波長的光線通過，從而增強熒光信號的強度和對比度。而普通顯微鏡則沒有這樣的濾鏡系統。

觀察方式：正置熒光顯微鏡利用特定波長的光激發樣品中的熒光物質，通過物鏡和目鏡系統放大觀察熒光圖像。這種觀察方式使得熒光顯微鏡能夠觀察到普通光學顯微鏡無法觀察到的生物樣品的內部結構。

應用范圍：正置熒光顯微鏡主要用于觀察和研究生物樣品中的熒光標記物或自發熒光的物質，廣泛應用于生物學、醫學和生物技術等領域。而普通顯微鏡則更多地用于觀察和研究非熒光物質的形態和結構。

綜上所述，正置熒光顯微鏡和普通顯微鏡在光源、照明方式、濾鏡系統、觀察方式以及應用范圍等方面存在明顯的區別。這些區別使得正置熒光顯微鏡在生物熒光觀察和研究中具有很好的優勢。