番茄內標準Apx基因探針法qPCR試劑盒實驗操作步驟
在完成反應體系配制后,將PCR管或96孔板短暫離心,確保液體集中于管底,避免氣泡干擾。隨后將反應板置于qPCR儀中,按照以下程序設置擴增條件:
1. 預變性階段:95℃維持30秒,充分激活DNA聚合酶并打開模板二級結構;
2. 循環擴增階段:95℃變性5秒,60℃退火/延伸30秒(根據引物Tm值可微調),重復40個循環;
3. 熔解曲線分析(可選):從60℃緩慢升溫至95℃,每0.5℃采集一次熒光信號,驗證擴增特異性。
實驗過程中需注意:
- 陰性對照:設置無模板對照(NTC)以排除污染風險;
- 重復孔:每個樣本至少設3個技術重復,確保數據可靠性;
- 熒光通道選擇:若使用探針法,需匹配儀器FAM/HEX等通道,避免信號串擾。
數據分析時,采用ΔΔCt法計算目標基因相對表達量。首先用內參基因(如Actin)Ct值校正樣本間差異,再通過實驗組與對照組的Ct差值比較獲得表達倍數變化。若熔解曲線出現多峰或陰性對照出現擴增,需排查引物二聚體或污染問題。
為提高實驗成功率,建議在正式實驗前進行預實驗優化退火溫度及引物濃度。此外,試劑盒開封后需分裝保存,避免反復凍融影響酶活性。通過嚴謹的操作流程和質控步驟,可確保番茄Apx基因表達分析的準確性和重復性。
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