液相色譜管路阻塞的原因：
1.沒有很好過濾流動相;
2.樣品中有微粒;
3.泵或進樣器墊圈產生碎片;
4.預柱、護柱和分析柱中漏出填料;
5,毛刺和銼屑進入;
6.流動相中的結晶鹽;
7.微生物
8.系統中進入了其它顆粒性物質。
液相色譜管路阻塞解決方法：
系統中管路阻塞的現象很少見，常見的是燒結過濾片（玻璃砂芯）阻塞。用燒結過濾器或過濾片（孔徑2-10um）能去掉阻塞管路的微粒（如0.25mm管徑）。用系統分段法檢查阻塞的管路，從后向前分別松開接頭檢查，找到阻塞管路后，應立即拆下來疏導或換新。
如果是非剛性物質阻塞，如生物樣品中的生化物質（蛋白質）、微生物等，可用極細的金屬絲導通，也可以在火頭上燒一燒，使有機物炭化，而后再導通。
如果是剛性物質阻塞，要導通則十分困難，采用反沖的辦法有時能成功。就是將管子調頭用泵沖洗。操作時要注意保護眼睛和裸露的皮膚，因阻塞物會以很高的速度沖出來。無法導通的管路要換上同樣規格的管子。如果換上新管后又被阻塞，則應該停機檢查上面提到的引起阻塞的幾種原因。