蛋白質定量分析方法:iTRAQ、SILAC、Label-Free與AQUA的比較檢測技術服務詳情介紹
在現代生命科學研究中,dànbáizhì定量分析是揭示生物過程機制、疾病標志物篩選、藥物作用機制解析等研究的重要手段。相較于dànbáizhì表達檢測方法,定量蛋白組學(Quantitative Proteomics)具備高通量、靈敏度高、可實現多樣本對比等優勢。當前主流的dànbáizhì定量技術主要分為四類:iTRAQ、SILAC、Label-Free與AQUA。每種方法各有特點,適用于不同的研究場景和樣本類型。本文將系統對比這些技術原理、優勢與局限,為科研人員選擇合適策略提供參考。
一、iTRAQ:基于標記的高通量定量策略
??技術原理
iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)是一種同位素標簽技術,通過將穩定同位素標記的試劑與肽段上的氨基結合,實現樣本間的定量比較。每種iTRAQ標簽在質譜一級(MS1)顯示相同質量,在MS2中通過釋放出特征報告離子實現多重樣本定量。
??優勢
可實現多達8或16個樣本的同時定量(取決于iTRAQ試劑套裝)
數據重現性好,適合大規模樣本研究
適用于復雜生物樣本,如組織、體液
??局限性
標記成本高,實驗操作復雜
存在比值壓縮(ratio compression)問題,可能影響定量精度
需要高分辨率質譜儀器支持,如Orbitrap或Q-TOF
??應用場景
適合需要高通量并行對比的研究,如疾病組學研究、藥效學分析等。
二、SILAC:細胞水平的同位素標記技術
??技術原理
SILAC(Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture)通過在細胞培養過程中引入含重氮或重碳的“輕/重”氨基酸,使蛋白在表達階段即完成標簽標記。標記后的樣本可直接進行LC-MS/MS分析,對比不同處理條件下的表達差異。
??優勢
標記效率高,避免樣本間變異
貼近生理條件,無需化學標記
數據準確性好,適合動態研究
??局限性
僅適用于可培養細胞體系
成本較高,對實驗室條件要求高
樣本通量有限,zuì多三種標記(輕、中、重)
??應用場景
適合研究細胞內信號通路、藥物干預機制等機制研究型課題。
三、Label-Free:不依賴標簽的簡便策略
??技術原理
Label-Free Quantification(LFQ)依賴于肽段的離子強度(peak intensity)或譜圖數(spectral count),通過對樣本中每個蛋白的信號進行相對定量,適用于無xiànliàng樣本。
??優勢
成本低、操作簡便,無需額外標記試劑
樣本通量無限,適合探索性研究
可適配多種質譜平臺
??局限性
對質譜平臺的穩定性要求高
定量精度相對標簽法略低
數據分析復雜度高,需zhuānyè算法支持
??應用場景
Label-Free特別適合早期探索性研究、樣本量較大的臨床樣本篩選等。
四、AQUA:juéduì定量的黃金標準
??技術原理
AQUA(Absolute QUAntification)采用已知濃度的穩定同位素合成肽作為內標,加入待測樣本中進行LC-MS/MS分析,通過標準曲線計算出目標蛋白的juéduì含量。
??優勢
可實現jīngquè的juéduì定量
高特異性,適合驗證階段
適用于低豐度蛋白或生物標志物的檢測
??局限性
需定制同位素肽段,成本高
目標蛋白數目受限
不適合高通量篩選
??應用場景
AQUA常用于生物標志物驗證、臨床檢測方法開發。
五、技術對比總結
百泰派克生物科技致力于提供高質量的定量蛋白組分析服務,依托*的質譜平臺與經驗豐富的分析團隊,我們可為客戶量身定制zuì優實驗流程,并提供高質量的數據挖掘與結果解讀。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!