Direct DIA：無需譜圖庫的高效蛋白質組分析流程檢測技術服務詳情介紹
在dànbáizhì組學研究中，數據非依賴性采集（Data-Independent Acquisition, DIA）因其高通量、重現性強、數據完整性好等優勢，正在迅速取代數據依賴性方法，成為主流技術之一。尤其是近年來興起的Direct DIA（Library-Free DIA）模式，更是在不依賴譜圖庫的前提下，實現了dànbáizhì組的高精度鑒定與定量，極大地降低了技術門檻并提升了數據處理效率。
一、什么是Direct DIA？
Direct DIA，即無需構建外部DDA譜圖庫的DIA數據分析方式。它跳過了DIA流程中先行進行數據依賴性采集（DDA）建庫的步驟，而是直接將DIA原始數據與參考蛋白數據庫進行比對，實現肽段識別與定量。這一過程主要依賴優良的譜圖預測算法、深度學習模型以及FDR控制技術，已逐步發展為一套成熟、標準化的dànbáizhì組學分析流程。DIA通常包括“先DDA建庫、后DIA分析”兩個階段，流程復雜、成本較高且譜圖庫覆蓋范圍受限。而Direct DIA則通過算法模型自動預測肽段碎裂譜圖，或從原始數據中構建內生譜圖庫，省去了建庫步驟，從而顯著簡化了整體實驗流程。
二、Direct DIA的技術支撐基礎
Direct DIA的實現依賴于三個關鍵技術環節：
1、深度學習預測譜圖
近年發展出的譜圖預測工具，如Prosit、DIA-NN和FragPipe等，已能夠根據肽段序列jīngzhǔn預測其在質譜中的碎裂模式。這些工具通常基于深度神經網絡，能夠輸出高質量的擬譜圖，用于替代傳統實驗獲得的真實譜圖，實現高精度匹配和定量。
2、嚴格的FDR控制與統計學建模
Direct DIA分析流程內置多層FDR控制策略，包括偽靶數據庫（decoy database）設計和多重假設檢驗機制，以確保在無需外部譜圖庫的情況下仍能保持肽段和蛋白鑒定的高可信度，常規分析中FDR可嚴格控制在1%以內。
3、高性能并行計算支持
由于Direct DIA需要處理大規模DIA碎片數據和復雜模型計算，通常依賴GPU并行計算或高性能計算集群，顯著提高數據分析效率。這一特性使其特別適用于大樣本量、多條件對比或臨床隊列研究。
三、Direct DIA的核心優勢
1、降低實驗前期負擔
DIA需優良行多次DDA實驗用于建庫，既耗時又增加樣本消耗。Direct DIA免除建庫流程，只需采集DIA數據，即可開展后續分析，顯著壓縮了實驗周期與資源投入。
2、提升分析一致性與重現性
由于Direct DIA不依賴特定實驗條件下構建的譜圖庫，其分析過程標準化程度更高，有效避免了批次間差異和建庫偏差，提升了數據的可比性和重復性，尤其適合多中心合作研究。
3、保持較高的靈敏度與覆蓋度
隨著譜圖預測技術不斷進步，Direct DIA已能在不犧牲鑒定深度的前提下，實現與建庫DIA相當甚至更優的性能，尤其在檢測低豐度蛋白、變異肽或修飾肽方面表現出色。
4、更適用于復雜或非標準樣本
對于臨床體液、FFPE組織、環境樣本等難以穩定建立高質量譜圖庫的樣本類型，Direct DIA提供了更靈活的解決方案，具備更強的適應性和推廣性。
5、成本控制更優，易于標準化推廣
通過簡化實驗流程、減少建庫成本與數據處理復雜性，Direct DIA為廣大科研實驗室提供了高性價比的解決方案，也為蛋白組學在臨床轉化中的大規模應用鋪平了道路。
四、Direct DIA的應用潛力
Direct DIA在多個研究方向中展現出jíqiáng的適應性與拓展性：
腫瘤和代謝疾病研究：適合分析復雜臨床樣本，助力發現差異表達蛋白與潛在生物標志物；
藥物作用機制探索：可用于高通量藥物處理組的蛋白譜監測，揭示調控路徑變化；
長期隊列研究：分析流程標準、數據重現性高，適合多時間點或多中心樣本比較；
多組學聯合分析：Direct DIA輸出數據結構化程度高，便于與轉錄組、代謝組等數據整合，進行系統生物學建模。
Direct DIA不僅極大簡化了實驗流程，還提升了分析效率和數據質量，為科研人員在復雜樣本、大規模隊列和臨床轉化研究中提供了更具可行性的技術路徑。百泰派克生物科技整合了優良的質譜儀器平臺與深度優化的數據分析流程，提供全流程的DIA定量dànbáizhì組學服務，覆蓋從樣本處理、質譜采集到數據解讀的每一個環節。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。
※服務優勢：
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢：
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢：
1.技術優良，*技術空白
采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大，成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；
2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；
4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；
5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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