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一文看懂多肽組學在癌癥檢測中的潛力檢測技術服務詳情介紹
多肽組學(peptidomics)作為質譜(mass spectrometry)驅動的生命科學分支,能全面分析體內天然存在的短肽或多肽片段。這些片段往往攜帶疾病特異性信息,是癌癥早期診斷和療效監測的新興生物標志物來源。本文將從技術基礎、應用前沿和發展趨勢三方面系統解析多肽組學在癌癥檢測中的潛力,并軟性植入 百泰派克生物科技 在該領域的優勢能力。
一、什么是多肽組學?
1、技術定位
。多肽組學研究的是未經酶切的內源短肽(約8–30?aa),與dànbáizhì組學(proteomics)相比,無需yídànbáiméi消化,能直接捕捉生理/病理生成的肽段
2、分離與檢測方法
。多肽組學通常采用液相色譜(LC)或基質輔助雷射解吸/電離(MALDI-TOF-MS)進行肽段分離和高分辨質譜分析
3、數據處理與識別
。利用 MS/MS 數據庫對接,配合生物信息學算法(如 DDA/DIA、深度學習),實現多肽序列的定性定量鑒定
二、多肽組學在癌癥檢測中的主要應用
1、早期癌癥篩查
(1)非小細胞肺癌(NSCLC): 血清多肽指紋圖譜有助于區分早期 NSCLC 與良性病變,以及健康對照。
(2)口腔癌預測: 通過口腔唾液或血清多肽組學發現與預后相關的候選多肽。
2、huàliáo療效與耐藥監測
肺鱗癌人群: 利用 MALDI-TOF-MS 分析huàliáo敏感組與耐藥組的血清多肽差異,建立療效預測模型。
3、miǎnyìzhìliáo靶點探索
(1)免疫多肽組學(Immunopeptidomics): 分析腫瘤細胞通過 MHC-I/II 遞呈的突變多肽(neoantigens),揭示腫瘤“暗物質”,為個性化腫瘤疫苗與 T?細胞療法提供靶點。
(2)生物信息聯動: 結合 WES、RNA-seq、in silico MHC 配對和 MS 數據,jīngzhǔn篩選具免疫原性的突變多肽。
4、抗腫瘤功能肽發現
。通過噬菌體展示、AI 篩選等策略,從毒液肽、天然生理肽庫中篩選具有腫瘤靶向或細胞毒性的功能多肽
三、優勢與挑戰
1、相比傳統生物標志物的優勢
(1)高靈敏性:可檢測低豐度肽段,反應早期病理變化。
(2)源于體內生成:無需酶切處理,保留了生理狀態下的結構和修飾。
(3)標志物通用性強:多肽指紋可適用于不同樣本來源,如血液、唾液、尿液。
2、當前挑戰
(1)樣本處理標準化不足,易影響肽譜穩定性和可重復性。
(2)高豐度肽遮蔽低豐度肽信號,需要豐富策略解決。
(3)臨床驗證不夠深入,多數研究仍處于候選驗證階段,缺少臨床試驗支撐。
(4)免疫肽識別算法仍需改進,MS 數據量大,需更準、更快的深度學習模型。
四、多肽組學典型流程
多肽組學的實驗流程需高度jīngzhǔn與標準化,以確保分析結果的重復性和生物學意義。以下是從樣本采集到生物標志物驗證的標準操作流程:
1、樣本采集與預處理
(1)樣本類型:多肽可來源于多種生物基質,如血清、血漿、尿液、腦脊液(CSF)、唾液及組織勻漿。
(2)關鍵考量:避免蛋白降解、肽段失活和預分析變化是核心,例如使用蛋白酶抑制劑、防凍劑,并快速凍存于 ?80?°C。
(3)標準化策略:統一采樣時間點、處理溫度與離心條件,以減少組間變異性。
2、多肽提取與富集
(1)蛋白沉淀去除:使用三lǜyǐsuān(TCA)、乙腈/甲醇沉淀或熱處理快速去除高豐度大分子蛋白,釋放內源多肽。
(2)固相萃取(SPE):C18 或強陽離子交換(SCX)柱常用于富集多肽,去除鹽類、小分子干擾物。
(3)高通量策略:自動化 SPE 平臺和磁珠富集技術提升處理效率并減少批間差異。
3、分離分析
(1)液相色譜質譜聯用(LC-MS/MS):以納升級 LC(nanoLC)結合高分辨率質譜(如 Orbitrap、TOF)進行肽段分離與檢測。
(2)MALDI-TOF-MS 分析:用于快速指紋分析與初篩,適合大樣本量、多組別研究。
(3)離子遷移譜(IMS)等新興技術:進一步提升肽段結構識別能力,分辨異構肽。
4、數據采集與定性定量
(1)數據采集模式:
DDA(Data-Dependent Acquisition):常用于探索性研究,捕捉信號zuì強的肽段進行 MS/MS。
DIA(Data-Independent Acquisition):全譜段掃描,適合大樣本、穩定性分析。
(2)定量方式:
標簽法(TMT/iTRAQ)用于多組比較。
無標記法(Label-Free)適合大規模隊列,簡化操作。
靶向法(MRM/PRM)用于生物標志物驗證。
5、生物信息學分析
(1)多肽識別:使用數據庫搜索引擎(如 Mascot、PEAKS、MaxQuant)結合深度學習模型輔助序列匹配。
(2)差異分析:結合統計學方法(如 t 檢驗、ANOVA)和多變量分析(如 PCA、PLS-DA),挖掘具有顯著差異的候選肽段。
(3)功能注釋與通路富集:對差異多肽進行 KEGG/GO 富集分析,揭示其潛在生物學功能。
(4)肽段溯源:將鑒定肽段追溯到上游蛋白及剪切機制,探索病理狀態下的蛋白水解調控網絡。
6、生物標志物驗證與臨床轉化
(1)靶向定量驗證:通過 MRM/PRM 質譜平臺,驗證候選肽在獨立隊列中的表達趨勢。
(2)免疫學方法融合:若開發抗體成功,可結合 ELISA、Western Blot 等手段進行臨床可轉化驗證。
(3)模型構建:通過機器學習(如 SVM、XGBoost)整合多個標志物,建立預測模型并評估其敏感性、特異性(AUC、ROC 分析)。
百泰派克生物科技在“多肽組學+癌癥檢測”領域,具備以下優勢:
1、gāoduān質譜平臺:采用 Orbitrap Fusion Lumos、Q?EQ96 等高分辨儀器,具備高通量電離能力。
2、zhuānyè技術團隊:SCI 出版及臨床項目背景團隊,熟練 LC-MS/MS、MALDI 和免疫多肽組學方法。
3、標準化流程與質量控制:從采樣、提取、檢測到數據管理,均可根據客戶需求設計并滿足 GLP/GCLP 標準。
4、定制開發能力強:支持多肽指紋庫構建、突變肽篩選與功能性驗證。
5、賦能客戶落地轉化:結合 MRM/PRM/ELISA 平臺,助力體外診斷試劑和臨床驗證的快速推進。
多肽組學是癌癥檢測中的科研前沿,具備高靈敏、結構保真、疾病特異性強的優勢,正逐步走向臨床應用。隨著免疫多肽組學與人工智能技術進步,多肽生物標志物的發現與驗證將更高效、更jīngzhǔn。百泰派克生物科技憑借*質譜平臺和zhuānyè研發能力,可為客戶提供“一站式”多肽組學服務,助力腫瘤標志物研究與體外診斷開發。如果您關注多肽組學在癌癥檢測的落地應用,歡迎聯系我們,共同探索jīngzhǔn醫學的未來。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!