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Edman降解 vs 質譜法:如何選擇合適的肽測序技術?檢測技術服務詳情介紹
肽測序是解析dànbáizhì一級結構的關鍵手段,廣泛用于蛋白鑒定、新序列確認、修飾位點定位及抗體研發等場景。目前,Edman降解和質譜法(Mass Spectrometry, MS)是兩種主流的肽測序技術,各具優勢,適用于不同實驗需求。本文從原理、性能與適用性三個維度系統比較二者,幫助科研人員選擇zuì契合的肽測序策略。
一、技術原理概覽
※ Edman降解:基于化學分解的順序識別
Edman降解通過苯異硫氰酸酯(PITC)與肽鏈N端氨基酸反應,逐個切除并識別N端殘基,按順序讀取肽段序列。該方法為線性測序,結果明確,且不依賴數據庫比對。
※ 質譜法:基于離子碎片的質量解析
質譜測序通常使用串聯質譜(MS/MS),將肽段離子化并誘導碎裂,通過檢測碎片的質量-電荷比(m/z),重建其氨基酸序列。配合數據庫搜索或de novo算法,可解析已知或未知肽段。
二、技術性能比較
三、適用場景建議
根據研究目標及樣本特性,肽測序技術選擇可遵循如下邏輯:
已知dànbáizhì鑒定:優選質譜法,速度快,信息量豐富。
未知蛋白序列分析:質譜de novo測序為shǒuxuǎn,必要時輔以Edman降解驗證N端序列。
N端序列確認:Edman降解直接讀取N端,結果清晰,適用于抗體或表達蛋白的起始位點驗證。
蛋白翻譯后修飾識別:質譜法具備強大的修飾位點解析能力,適用于磷酸化、乙酰化等功能研究。
樣本復雜、通量要求高:質譜法更具效率,適配性強。
單一、多次重復驗證需求:Edman降解可提供穩定且可控的序列讀取結果,適合結構確認。
四、技術發展趨勢與整合應用
隨著儀器分辨率、碎片識別算法和數據庫建模技術的不斷進步,質譜法已成為當前蛋白zhìzǔxué及功能蛋白研究中的主流工具。其高通量、多維度信息解析能力,使其在科研和生物醫藥研發中具備廣泛適應性。盡管如此,Edman降解仍在某些高要求精度場景中發揮bùkětìdài的作用,特別是在需要直接確認N端序列、剔除算法預測誤差或驗證工程蛋白表達正確性時。在實際應用中,科研人員可根據實驗目標,將Edman降解與質譜法聯合使用,以獲得更全面、可靠的肽段結構信息。
百泰派克生物科技可根據客戶樣本類型與研究目的,定制適合的測序策略,兼顧效率與精度,支持從基礎科研到產業轉化的多種應用需求。通過科學的技術整合方案,助力科研人員獲取清晰、可信的蛋白序列信息。歡迎聯系我們獲取項目建議與技術支持!
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白zhìzǔxué
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!