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單細胞TCR測序檢測技術服務詳情介紹
單細胞TCR測序是用于分析單個細胞水平上的T細胞受體(TCR)序列的基因組學技術。T細胞受體是T細胞表面的dànbáizhì復合物,負責識別抗原并啟動免疫反應。TCR的多樣性決定了T細胞識別不同抗原的能力,研究TCR的序列有助于理解免疫系統的功能和疾病機制。在腫瘤免疫研究中,單細胞TCR測序可以幫助識別腫瘤浸潤淋巴細胞(TILs)的TCR譜系,從而鑒定抗腫瘤反應的T細胞克隆。這為開發個性化免疫療法提供了可能性,能夠幫助設計更有效的T細胞療法和預測患者對免疫檢查點抑制劑的反應。在傳染病研究中,該技術能夠解析感染過程中T細胞的動態變化,識別病原體特異性T細胞,從而闡明免疫應答的機制。單細胞TCR測序在自身免疫疾病中的應用包括揭示疾病相關T細胞的特征和功能狀態,幫助理解疾病的發病機制。還可以用于監測治療效果,通過分析治療前后T細胞克隆的變化,評估治療的有效性和調整治療方案。在疫苗開發領域,單細胞TCR測序可以用于分析疫苗接種后T細胞反應的多樣性,幫助優化疫苗的設計和評估其免疫原性。
一、單細胞TCR測序的技術流程
單細胞TCR測序的技術流程主要包括單細胞分離、TCR擴增和高通量測序三個關鍵步驟。單細胞分離通常通過流式細胞術或微流控技術實現,確保每個單細胞能夠被單獨分離和分析。流式細胞術通過標記特定的表面標志物,將T細胞從復雜的細胞混合物中分離出來,而微流控技術則利用微小的流體通道,將單個細胞封裝在液滴中進行隔離。而TCR擴增通常利用逆轉錄PCR(RT-PCR)技術,將TCR的RNA轉錄為cDNA,并進行擴增。TCR的多樣性主要體現在其可變區的序列,因此擴增過程需要針對TCR的可變區進行特異性引物設計,以確保高效和準確的擴增。單細胞TCR測序的zuì后一步是高通量測序,通過新一代測序技術,對擴增產物進行序列分析。測序數據經過生物信息學分析,能夠揭示TCR的序列特征和多樣性,進而反映出T細胞的功能狀態和免疫反應的特異性。
二、單細胞TCR測序的挑戰
技術層面,單細胞TCR測序要求高精度的擴增技術,以確保TCR的α鏈和β鏈正確配對。測序深度是另一個挑戰,過低的深度可能錯失低豐度克隆,影響免疫圖譜的準確性。數據分析方面,TCR序列的多樣性和高度可變性對序列比對和克隆識別提出了挑戰。現有算法可能無法充分應對TCR序列變異的復雜性,導致錯配或錯誤的克隆歸類。此外,單細胞數據的高維性和噪聲水平要求使用復雜的生物信息學分析工具,解析這些數據需要強大的計算資源和zhuānyè知識。
百泰派克生物科技提供高質量的服務。我們的團隊由經驗豐富的科學家組成,能夠根據客戶的研究需求定制個性化的實驗方案。我們采用先進的數據分析平臺,以確保數據的準確性和可靠性,助力客戶在基礎研究和臨床應用中取得突破性進展。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!