化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)如何提升蛋白靶點(diǎn)識(shí)別的精準(zhǔn)度？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在新藥研發(fā)、機(jī)制研究以及功能蛋白探索等多個(gè)領(lǐng)域，蛋白靶點(diǎn)識(shí)別的準(zhǔn)確性始終是科研人員面臨的核心挑戰(zhàn)之一。傳統(tǒng)的dànbáizhì組學(xué)手段雖已實(shí)現(xiàn)高通量檢測，但在直接鑒定小分子或候選藥物與靶蛋白之間的相互作用方面，仍存在“脫靶高、特異性低”的痛點(diǎn)。而隨著技術(shù)演進(jìn)，化學(xué)dànbáizhì組學(xué)（Chemical Proteomics）作為一項(xiàng)集成了化學(xué)工具與質(zhì)譜技術(shù)的新興策略，正在重塑我們識(shí)別和驗(yàn)證蛋白靶點(diǎn)的方式。

一、什么是化學(xué)dànbáizhì組學(xué)？

化學(xué)dànbáizhì組學(xué)是一種利用功能化小分子探針、共價(jià)標(biāo)記策略與高分辨質(zhì)譜聯(lián)用的技術(shù)體系，旨在在全蛋白組水平上分析小分子與蛋白的直接或間接結(jié)合。與傳統(tǒng)蛋白組學(xué)的“觀察蛋白表達(dá)變化”不同，化學(xué)dànbáizhì組學(xué)關(guān)注的是“蛋白-配體”的真實(shí)互作關(guān)系，特別適合篩選藥物作用靶點(diǎn)、研究蛋白功能網(wǎng)絡(luò)、以及解析作用機(jī)制。

? 常見策略包括：

• 活性位點(diǎn)標(biāo)記（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）

• 光交聯(lián)標(biāo)記（Photoaffinity Labeling, PAL）

• 親和捕獲-質(zhì)譜分析（Affinity Capture-MS）

• 靶向共價(jià)化學(xué)蛋白組學(xué)（Covalent Chemical Proteomics）

二、為什么傳統(tǒng)方法難以jīngzhǔn識(shí)別蛋白靶點(diǎn)？

在缺乏化學(xué)標(biāo)記手段的條件下，蛋白靶點(diǎn)識(shí)別主要依賴轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異分析或基于表型的推斷模型。這類方法雖具高通量能力，但存在以下局限：

• 間接性強(qiáng)：無法直接觀測藥物與靶蛋白的結(jié)合行為

• 脫靶效應(yīng)隱匿：無法識(shí)別與候選分子非特異結(jié)合的蛋白

• 空間分辨率低：缺乏亞細(xì)胞定位或動(dòng)態(tài)變化信息

• 低豐度蛋白難捕獲：受限于蛋白表達(dá)量

三、化學(xué)dànbáizhì組學(xué)如何提升靶點(diǎn)識(shí)別jīngzhǔn度？

1、原位識(shí)別真實(shí)結(jié)合靶點(diǎn)

通過在小分子結(jié)構(gòu)中引入光敏基團(tuán)（如苯甲酮）或親電探針，化學(xué)dànbáizhì組學(xué)能夠在活細(xì)胞或組織中進(jìn)行交聯(lián)反應(yīng)，實(shí)現(xiàn)原位標(biāo)記。這種策略消除了細(xì)胞裂解過程中的假陽性干擾，更接近生理狀態(tài)下的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。例如，ABPP可將功能基團(tuán)jīngquè定位到蛋白活性中心，使得僅有具有催化活性的靶蛋白被富集，從而實(shí)現(xiàn)特異性jígāo的靶點(diǎn)捕獲。

2、共價(jià)捕獲提升低豐度蛋白識(shí)別率

傳統(tǒng)親和純化容易丟失低表達(dá)或短時(shí)存在的蛋白結(jié)合物。而化學(xué)dànbáizhì組學(xué)通過共價(jià)鍵固定蛋白-配體復(fù)合物，可在洗脫、純化過程中保持結(jié)合狀態(tài)，大幅提高低豐度蛋白和瞬時(shí)互作的檢出率。例如，采用含有硫酰基或炔基的共價(jià)探針，可在反應(yīng)后進(jìn)行Click反應(yīng)富集，進(jìn)而通過LC-MS/MS實(shí)現(xiàn)靶蛋白高靈敏識(shí)別。

3、靶標(biāo)鑒定與位點(diǎn)解析同步完成

不同于傳統(tǒng)的“先找蛋白再找結(jié)合位點(diǎn)”，化學(xué)dànbáizhì組學(xué)可通過標(biāo)記殘基的肽段信息，在一次質(zhì)譜分析中同步得到：

• 哪個(gè)蛋白被標(biāo)記

• 標(biāo)記發(fā)生在哪個(gè)氨基酸位點(diǎn)

• 相互作用的類型（共價(jià)/非共價(jià)）

這一優(yōu)勢特別適用于結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)藥物設(shè)計(jì)（Structure-based Drug Design），可為后續(xù)分子優(yōu)化提供jīngquè的結(jié)合位點(diǎn)依據(jù)。

4、可與定量蛋白組學(xué)無縫整合

現(xiàn)代化學(xué)dànbáizhì組學(xué)方案常與TMT標(biāo)記、SILAC、DIA等定量策略協(xié)同使用，實(shí)現(xiàn)藥物處理前后蛋白結(jié)合情況的動(dòng)態(tài)定量。

? 這一策略尤其適合：

• 比較不同化合物或劑量的靶點(diǎn)差異

• 驗(yàn)證藥物特異性

• 評(píng)估結(jié)合強(qiáng)度與劑量響應(yīng)關(guān)系

在jīngzhǔn醫(yī)學(xué)和新藥開發(fā)加速推進(jìn)的背景下，單靠傳統(tǒng)的蛋白組學(xué)手段已難以滿足對(duì)靶點(diǎn)識(shí)別“高準(zhǔn)確率、強(qiáng)特異性、全景覆蓋”的需求。化學(xué)dànbáizhì組學(xué)以其dúyǒu的原位標(biāo)記能力、共價(jià)捕獲機(jī)制和位點(diǎn)級(jí)解析優(yōu)勢，正在成為未來藥靶研究的工具。百泰派克生物科技化學(xué)dànbáizhì組學(xué)全面解決方案包括從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣品制備、探針合成、靶標(biāo)鑒定以及數(shù)據(jù)分析的全流程，歡迎聯(lián)系我們，開啟定制化化學(xué)dànbáizhì組學(xué)服務(wù)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)如何提升蛋白靶點(diǎn)識(shí)別的精準(zhǔn)度？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹