ABPP為何被稱為“功能蛋白組學”的利器？原理+應用全解讀檢測技術服務詳情介紹

科研真實痛點：蛋白“表達”≠蛋白“活性”

在生命科學研究和新藥開發中，科研人員經常遇到這樣的現象：

1、某酶在轉錄組和蛋白組中高表達，但功能驗證卻毫無活性；

2、藥物處理后，靶蛋白表達量無變化，卻產生了顯著生物效應；

3、多條候選靶點通過表達組篩選出來，功能驗證成功率卻極低。

這些“謎團”的核心是：表達不等于功能。dànbáizhì組技術（如DDA、DIA、TMT定量）雖然可以識別和定量大量dànbáizhì，但它們無法區分“沉睡狀態”的酶與真正發揮催化作用的活性蛋白。而ABPP（Activity-Based Protein Profiling），正是解決這一痛點的關鍵wǔqì。它跳出“表達水平”的限制，通過化學探針jīngzhǔn識別處于活性狀態的酶類蛋白，為dànbáizhì組研究帶來“功能維度”，成為“功能蛋白組學”的利器。

一、重新定義蛋白組學：ABPP的功能識別邏輯

1、ABPP的dútè之處

ABPP是一種選擇性識別“活性酶”的化學標記技術，它的基本邏輯是用結構特異性的共價探針，在復雜樣本中選擇性標記活躍酶類的催化中心，進而通過質譜等手段識別這些功能蛋白。

它與蛋白組學zuì大區別在于：

（1）不看總量，而是看“有沒有功能”；

（2）不看表達差異，而是看“催化能力”；

（3）只關注“正在工作的dànbáizhì”。

2、探針=“酶類活動zhēnchá器”

每一類酶（如sīānsuān水解酶、半胱天冬酶、金屬蛋白酶）都有其dútè的活性位點化學結構。ABPP探針設計時，正是利用這些結構活性特征，合成能特異結合并共價標記的化合物結構。

探針通常由三部分構成：

通過探針的選擇性，ABPP實現了對活性酶類的特異識別，這在表達組學和非bǎxiàngdàn白組方法中是難以做到的。

二、從“篩選”到“確認”：ABPP如何提升靶點發現效率？

在藥物開發中，“靶點發現”一直是瓶頸階段之一。表達組學給出的候選靶點常常多達幾百個，但zuì終能夠通過功能驗證的常常liáoliáowújǐ。ABPP通過功能層面篩選，大幅提升了候選靶點的“mìngzhònglǜ”，其具體機制包括：

1、差異活性分析

在藥物處理組與對照組中加入相同ABP探針，通過質譜檢測探針結合蛋白：

（1）如果某酶在藥物處理組中探針信號顯著降低 → 表明藥物可能與該酶競爭性結合；

（2）如果某酶在疾病模型中活性升高 → 提示其可能為病理驅動因子；

2、競爭型ABPP驗證

在候選靶點篩選之后，可引入競爭實驗：

（1）先加入藥物，使其與目標酶結合；

（2）再加入探針，觀察是否阻斷探針結合；

（3）若阻斷xiàoguǒxiǎnzhù，說明藥物靶向該酶位點，有很強的直接靶點證據。

這類方法已成為驗證共價藥物直接靶點的“黃金標準”。

三、應用深度遠超傳統認知：ABPP能做什么？

1、新藥靶點確認與脫靶評估

ABPP特別適合小分子藥物與酶類靶點的作用研究，尤其是共價抑制劑。它不僅可以確認藥物靶點，還可以提前識別潛在脫靶酶，降低毒性風險。

2、疾病酶譜繪制與功能標志物挖掘

在腫瘤、自身免疫、神經退行性疾病中，ABPP可系統描繪酶活性異常的通路節點，輔助發現“功能性生物標志物”。

3、篩選天然產物或先導化合物靶點

天然產物的機制常常模糊不清。ABPP可直接識別它們與酶類的結合譜圖，將靶點確認前移至篩選早期，避免資源浪費。

構建功能蛋白圖譜和動力學分析模型4、

結合不同時間點/條件變化的ABPP圖譜，研究者可以重建生理/藥理過程中的功能酶動態變化，推動系統生物學建模。

四、技術挑戰 & 百泰派克的解決方案

盡管ABPP在功能蛋白研究中前景廣闊，但其實際落地仍有多個技術門檻。百泰派克提供從探針到數據的全鏈路解決方案：

ABPP提醒我們，不能只滿足于知道蛋白“是否存在”，而必須進一步追問——“它是否活躍？是否發揮作用？”在這個層面，ABPP是目前為止zuì有效、zuì成熟、zuì具可擴展性的解決方案。百泰派克生物科技，作為國內lǐngxiān的功能蛋白組學服務提供商，已協助數十家高校、藥企、醫院開展ABPP項目，真正將功能視角轉化為可驗證的科研與臨床成果。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術先進，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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